Hablar de su escudo es remontarse a su historia, esta formado por sus seis estrellas (dos de Liga a su derecha y cuatro las de Copa sobre un balón) y un listón azul que se dice se debe al cielo azul que se podía ver en un pasado en la ciudad al mirar hacia arriba, el listón viaja por la periferia para cruzar el centro y soportar su nombre: Puebla F.C.

A lo largo de la historia el escudo ha ido cambiando no solo en su forma y al agregarle las estrellas que representan los trofeos que fueron alzados por el equipo, sino que incluso ha llegado a cambiar de color ya que así fue decidido por los empresarios que manejaron en determinado momento al equipo.